公路

雨花台区联接皖南、皖北和苏南、苏北，是连接华东、华中、华南、华北的重要交通枢纽。

截至2022年，雨花台区境内有205国道、宁芜高速公路、宁丹高速公路、宁溧高速公路、宁马高速公路、南京绕城高速公路、南京机场高速公路等20多条干道穿境而过。此外，南京汽车客运南站也位于雨花台区境内。 

铁路

截至2022年，雨花台区境内有南京南站（亚洲最大的铁路枢纽），京沪高速铁路、沪汉蓉高速铁路、宁杭高速铁路、宁安高速铁路、宁安铁路货线穿境而过。

航运

截至2022年，雨花台区境内有南京港板桥港区一个港区。

南京港是亚洲最大内河港口，是中国沿海的主枢纽港和对外开放一类口岸，也是长江流域水陆联运和江海中转的枢纽港，处于铁路、公路、管道、航空和水运的交会点，是长三角唯一实现集装箱铁路与水路无缝对接的港口，已成为中国华东地区及长江流域江海换装、水陆中转、货物集散和对外开放的多功能江海型港口，也是中国连结全球的江海转运综合枢纽。

地铁

截至2022年，雨花台区境内有5条地铁线路。