截至2019年，玄武区境内有312国道、沪宁高速公路、宁杭公路、南京绕城高速公路等穿境而过。此外，南京汽车客运站和南京长途汽车东站均坐落在玄武区境内。

截至2019年，玄武区境内有南京站，京沪铁路、宁芜铁路、宁西铁路、宁启铁路、沪宁高铁穿境而过。 

截至2019年，玄武区境内有4条地铁线路。